Die reformierte Kirchgemeinde Seebach erlangte 1863 ihre Selbständigkeit. Zuvor war sie eine Filialkirche des Grossmünsters. Als solche geht sie zurück auf das Jahr 1664, als die Niklauskapelle erstellt und eingeweiht wurde. In den frühen 1930er Jahren ist es der reformierten Kirchgemeinde Seebach gelungen, auf der Buhn gleich neben dem geplanten Schulhaus Buhnrain ein geeignetes Stück Land für den Bau einer neuen Kirche zu erwerben. Wegen der Krisenjahre und dem zweiten Weltkrieg dauerte es dann aber noch bis 1947, bis mit dem Bau der Markuskirche begonnen werden konnte.
Folgende im reformierten Raum sogar weltbekannte Persönlichkeiten waren hier in Seebach zu Gast:
- Prof. Robert Hood, Neujork, ein enger Freund von Desmond Tutu - Prof. und Schriftstellerin Dorothee Sölle, sie lehrte in Neujork - Prof. Hans-Joachim Kraus; Moderator des Reformierten Bundes in Deutschland
Sie alle sind gut befreundet mit dem reformierten Seebacher Pfarrer Rolf-Joachim Erler.
Die Predigt von Johannes Rau, späterer deutscher Bundespräsident, gehalten in der Markuskirche am Pfingstsonntag, den 14. Mai 1989 wurde am Schweizer Fernsehen direkt übertragen.
Im Jahre 1993 wurde ein Gottesdienst in der Markuskirche sogar über Eurovision ausgestrahlt.
Der Beitrag zur reformierten Kirchgemeinde Seebach wird laufend aktualisiert und erweitert. Seit 1980 organisiert die Reformierte Kirchgemeinde Seebach auf der Buhn das sogenannte Kolibrilager für Kinder vom ersten Chindsgi bis zur ersten Oberstufe. Weitere Informationen findet man in der Quartierchronik «Unser Seebach» ab Seite 103.